MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL5

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012000	CTAAA	2	10	29	38	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012000	TAA	2	6	81	86	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012000	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012000	ATA	2	6	125	130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012000	TCT	2	6	135	140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012000	T	7	7	216	222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012000	AAT	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012000	ATTA	2	8	336	343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012000	TA	3	6	381	386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012000	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012000	TCT	2	6	427	432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012000	AAT	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012000	TG	3	6	484	489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012000	A	6	6	511	516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012000	T	7	7	543	549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012000	AAT	2	6	582	587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012000	A	6	6	1606	1611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012000	AAG	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012000	AT	4	8	1649	1656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012000	GAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012000	A	7	7	1707	1713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012000	CTT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012000	T	7	7	1778	1784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012000	T	7	7	1786	1792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012000	T	7	7	1846	1852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012000	T	6	6	1866	1871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012000	ACT	3	9	1918	1926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012000	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012000	TTC	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012000	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012000	TTTA	2	8	2007	2014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012000	ATAA	2	8	2124	2131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012000	CAC	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012000	TATAA	2	10	3983	3992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012000	CGT	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012000	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012000	TCAAAA	2	12	4158	4169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012000	TAA	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012000	AATT	2	8	4201	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012000	ATT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012000	T	7	7	4240	4246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012000	ACTT	2	8	4278	4285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012000	AAT	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012000	AAT	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012000	CAA	2	6	4312	4317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.